软件著作权在以下情况下可以重复申请：
1. 不同版本：如果软件有多个版本，每个版本都具有独立的著作权。每个版本都需要单独申请著作权，即使它们的核心功能相同。
2. 重大更新：如果软件进行了重大更新或升级，并且这些更新或升级引入了显著不同的功能或设计，那么可以针对更新后的软件版本申请新的著作权。
3. 衍生作品：如果基于原始软件创作了新的衍生作品，例如插件、扩展或定制版本，那么可以针对衍生作品申请新的著作权。
4. 国际保护：如果软件在多个国家或地区发布，那么需要在每个国家或地区单独申请著作权，以获得相应的法律保护。